MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 2993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002491	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002491	T	7	7	349	355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002491	CTT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002491	TC	3	6	377	382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002491	GTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002491	AAG	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002491	AAC	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002491	AG	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002491	T	6	6	494	499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002491	TCTT	2	8	512	519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002491	GTCT	2	8	3851	3858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002491	A	6	6	3860	3865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002491	T	7	7	3900	3906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002491	CTAC	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002491	GCTT	2	8	4062	4069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002491	TCTTAT	2	12	4070	4081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_002491	TG	3	6	6911	6916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002491	TG	3	6	6977	6982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002491	GAG	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002491	T	6	6	7328	7333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002491	CTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002491	T	6	6	7349	7354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002491	TCT	2	6	7435	7440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002491	ATG	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002491	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002491	TCGC	2	8	10198	10205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002491	ACG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002491	CTT	2	6	10309	10314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002491	AATAA	2	10	10375	10384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002491	ATG	2	6	10427	10432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002491	C	14	14	10476	10489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_002491	CT	3	6	10494	10499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002491	TTG	2	6	10561	10566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002491	AGG	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002491	GTT	2	6	11402	11407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002491	GGA	2	6	11409	11414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002491	CGTA	2	8	11469	11476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002491	TTTA	2	8	12852	12859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002491	TA	3	6	12929	12934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002491	TAG	2	6	12936	12941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002491	CAC	2	6	12978	12983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_002491	C	13	13	13020	13032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_002491	TCT	2	6	13053	13058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002491	T	6	6	13088	13093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002491	T	6	6	15456	15461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002491	TAT	2	6	15470	15475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002491	GA	3	6	15491	15496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002491	ATT	2	6	15514	15519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002491	TTA	2	6	16311	16316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002491	TCT	2	6	17972	17977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002491	A	6	6	18093	18098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002491	ACA	2	6	18147	18152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002491	CTTT	2	8	18204	18211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002491	ATCT	2	8	18212	18219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002491	GAAA	2	8	18229	18236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002491	A	7	7	18249	18255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002491	GTT	2	6	18257	18262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002491	AGA	2	6	20869	20874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002491	CT	3	6	20894	20899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002491	TAG	2	6	20980	20985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002491	TCGATT	2	12	23927	23938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_002491	T	7	7	23972	23978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002491	A	7	7	23997	24003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002491	CT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002491	TATTT	2	10	26933	26942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002491	GTT	2	6	26960	26965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002491	TGT	2	6	26999	27004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002491	T	6	6	27040	27045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002491	GAA	2	6	27055	27060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002491	TCTAG	2	10	27100	27109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002491	T	6	6	27116	27121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002491	AGA	2	6	28686	28691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002491	AG	3	6	30056	30061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002491	TTG	2	6	30095	30100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002491	TC	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002491	T	7	7	30152	30158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002491	AGA	2	6	30163	30168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002491	AGG	2	6	30240	30245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002491	CTC	2	6	34664	34669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_002491	TGC	2	6	36294	36299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002491	CTT	2	6	37331	37336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002491	TA	3	6	38321	38326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002491	T	6	6	38353	38358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002491	TTG	2	6	38395	38400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002491	CT	3	6	39315	39320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002491	T	6	6	39368	39373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002491	TGTC	2	8	41931	41938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002491	TAC	2	6	42012	42017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002491	AT	3	6	42038	42043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002491	A	6	6	42053	42058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002491	T	7	7	42111	42117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002491	T	6	6	42119	42124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002491	A	8	8	42126	42133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002491	T	6	6	42201	42206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002491	ATTTTT	2	12	43005	43016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002491	T	8	8	43012	43019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002491	GCG	2	6	43440	43445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002491	TTTC	2	8	43491	43498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002491	TTG	2	6	43522	43527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002491	T	7	7	43538	43544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002491	T	6	6	44221	44226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002491	TTG	2	6	44230	44235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002491	AGT	2	6	44275	44280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002491	ATT	3	9	44319	44327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002491	TTAT	2	8	44353	44360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002491	TAA	3	9	44365	44373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002491	GA	4	8	45798	45805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002491	CTT	2	6	47858	47863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002491	GTT	2	6	49145	49150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002491	A	6	6	49157	49162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002491	ATT	2	6	49204	49209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002491	TTG	2	6	49229	49234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002491	T	7	7	53520	53526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002491	ATG	2	6	53542	53547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002491	A	6	6	53598	53603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002491	CGG	2	6	53615	53620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002491	TATC	2	8	53925	53932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002491	T	6	6	55365	55370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002491	TTC	2	6	55453	55458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002491	TA	3	6	55494	55499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002491	TAG	2	6	55501	55506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002491	CAC	2	6	55543	55548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_002491	CAC	2	6	55574	55579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_002491	C	6	6	55585	55590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_002491	TCT	2	6	55616	55621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002491	T	6	6	55651	55656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002491	GAA	3	9	57017	57025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002491	GCTAA	2	10	57862	57871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_002491	CAG	2	6	57872	57877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002491	GCA	2	6	57879	57884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002491	GCA	2	6	57892	57897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002491	AGA	2	6	57936	57941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002491	TTTA	2	8	57972	57979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002491	T	7	7	58027	58033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002491	TA	3	6	58054	58059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002491	AGTT	2	8	58070	58077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002491	CAC	2	6	58103	58108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_002491	ACA	2	6	60068	60073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002491	AAGT	2	8	60454	60461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002491	TTTA	2	8	60482	60489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002491	T	7	7	60549	60555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002491	TAG	2	6	60574	60579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002491	CACC	2	8	60647	60654	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_002491	C	6	6	60662	60667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_002491	CTT	2	6	60687	60692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002491	T	6	6	60724	60729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002491	AG	3	6	63038	63043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002491	AGA	2	6	63093	63098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002491	A	6	6	63109	63114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002491	GT	3	6	63352	63357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_002491	T	7	7	187520	187526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_002491	TCA	2	6	192208	192213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_002491	G	6	6	195015	195020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
445	NC_002491	T	6	6	195080	195085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_002491	TA	5	10	195122	195131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_002491	T	6	6	199122	199127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_002491	TCT	2	6	199911	199916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_002491	CT	3	6	209472	209477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
492	NC_002491	TTC	2	6	209479	209484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_002491	CTT	2	6	209504	209509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_002491	ATGAT	2	10	210699	210708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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